第110章 基因敲除
第110章 基因敲除
林明和卡特琳娜吃過晚飯，相跟著向實驗室溜達去。
卡特琳娜每天吃完晚飯要先睡一個小時再去實驗室，以確保做實驗時精力充沛，可今天有林明擾她，睡不成覺了，她只能端著一杯濃咖啡以備提神。
「如果你修習王瑜伽調息和制感，連站著都能打一個高質量的盹，多打幾次盹，比喝咖啡強。」林明道。
「打盹還需要修習調息和制感？我每天從早上六點半忙到現在，中間不打盹早過勞猝死了。」卡特琳娜翻白眼道，「一天能見縫插針地打好幾次盹。」
凡是從事高強度工作的人，一般都有自己調理放鬆的小妙招，沒有小妙招的愣頭青都會被早早淘汰掉。
「那倒不錯。」林明點頭，「不過打盹也有質量高低之分，拿我自己的體驗來說，打一個幾分鐘的高質量盹能頂半小時的低質量睡眠。」
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「修習調息制感不需要時間？哪有那時間。」卡特琳娜無奈道，「打盹還得瞅個空才能打呢。」
這話就沒法兒再談下去了，林明無奈閉嘴。
他和卡特琳娜雖然都很忙碌，他甚至比卡特琳娜還要忙，但他的時間大多可以自己主導，卡特琳娜的時間卻不由她自己來主導，身為一個住院醫，她隨時都會被別人支配，這的確是很不同的。
這麼溜達著，兩人來到實驗室。
實驗室里燈火通明，但氣氛不對。
陳清源、布蘭登、戴維，還有一個林明沒見過的新研究助理，四個人圍在操作台前盯著一個平板屏幕，上面是一張測序峰圖。
此外還有兩個實驗輪轉研究生站在外圍。
沒人說話，空氣像凝固了一樣。
「陳教授。」林明輕聲招呼了一聲，「這是————」
「來了？」陳清源抬頭看看林明和卡特琳娜，臉上連一絲笑意都擠不出來，聲音沙啞，「基因敲除成功了————但耐藥性一點沒消失。」
（基因敲除，即把一個基因組的基因模塊清除掉，然後看細菌會有什麼變化，從而反向推導這個基因模塊的功能。這是基因編輯研究工作中的一種重要研究模式。）
林明和卡特琳娜湊過去看著平板屏幕上的測序峰圖，眉頭皺起來。
他倆都明白，這對陳教授他們的課題意味著什麼一如果能敲掉細菌的某個基因模塊，讓細菌不再耐藥，那就證明該模塊是耐藥的關鍵，也是新藥研發的絕佳靶點。
基因敲除這項工作做起來極其繁瑣，需要設計「導航儀」gRNA，設計「剪刀」Cas9蛋白。
而敲除的過程也全是坑。
你可能會敲除錯基因模塊，可能敲除不乾淨，等等，這都會影響到實驗結果。
陳教授他們經過這一系列艱難工作，如今好不容易基因敲除成功了，但細菌的耐藥性卻紋絲不動！
這就意味著，他們苦苦尋找的那個「關鍵耐藥模塊」，根本不是目前敲除的這個！
陳教授嘆了口氣，指著屏幕上清晰的峰圖：「我們設計的gRNA導航得很準，Cas9剪刀也剪得乾淨，目標基因模塊被完全敲除了，但細菌還是耐藥。」
「這說明整個實驗方向可能走偏了————」
「這是第三次了。」旁邊的布蘭登苦笑著搖了搖頭，「前兩次要麼脫靶，要麼敲除不完全。這次好不容易100%敲除成功，結果卻是這樣————」
「有沒有可能，」林明謹慎道，「被敲除掉的這個基因模塊的功能，被其他基因模塊代償了？」
「也有可能，」陳教授苦笑，「可這就需要更繁重的工作量了，現在這個課題的經費都成問題了，耗不起啊————」
實驗室里再次陷入一片死寂。
林明和卡特琳娜也沉默著，心裡很替他們難過，不知道再該說什麼。
但同時，他們心裡也悄悄鬆了一口氣。
他們自己的課題即將進入機制研究，雖然也不容易，但比起陳教授這邊，難度明顯低了一大截。
陳教授的課題必須深入基因編輯層面，要做複雜的基因敲除—
他們要找到單個耐藥基因當靶點，敲掉它→細菌不耐藥=實錘，這是現代藥的研發思路，不做敲除就無法坐實結論。
而林明他們研究中藥複方，走的是完全不同的路：
不靠單一基因，而是靠多成分、多靶點共同壓制耐藥性。
他們只需要觀察細菌表型、檢測基因表達變化、分析代謝通路，就能證明黃連解毒湯為何能延緩甚至逆轉耐藥。
「行了，今天就到這裡吧，都累了，回去休息。」
陳清源靠在操作台邊，揉了揉眉心道。
但沒人動，所有人臉色都很沉重。
布蘭登、戴維，還有那位頂替卡特琳娜的新研究助理，心情比陳清源還要糟糕。
陳清源是PI、是課題組負責人，經費來自項目基金，課題失利並不用自掏腰包，哪怕這個方向走不通，他也有資歷和資源去申請下一個課題。
但布蘭登他們不一樣。
這次老闆用了他們，下個課題未必還會選他們。
這意味著，他們很可能直接失去當前的科研崗位，學術上的晉升、發文章、積累成果的機會，自然也一併泡湯。
「不說我們課題了，你們那個課題進行到哪一步了？」陳清源問林明。
「正在做劑量梯度實驗，今天查看結果。」林明道。
「那就查看吧？」陳清源道。
林明和卡特琳娜就打開飼養箱查看，布蘭登和那個新的研究助理也過來幫忙。
查看結果，1：2濃度毒性太大，近三成蠟螟出現肢體僵硬；1：16濃度效果不明顯；1：4
和1：8都有效，但1：8效果最好，存活率75%，而且蠟螟活力明顯優於其他組。
這時，蒂莫西和劉偉也先後趕到了。
「咦～，這數據不錯！頭兒，咱們是不是可以進入機制實驗了？」
蒂莫西和陳教授、布蘭登打過招呼，看了一下數據，興奮地對林明道。
劉偉站在一邊也是一臉興奮。
「還不行，每組20隻的樣本量統計學效力依舊不足，只能算趨勢參考，達不到定論標準。」
卡特琳娜摘下護目鏡，指尖輕揉酸脹的眼尾，語氣平靜道。
「我覺得接下來，我們應該集中全部實驗資源，做大樣本重複驗證實驗，每組擴至30
只，設置四組平行對照，把藥效數據做紮實，拿到統計學顯著差異的結論後，我們再啟動作用機制的探索實驗。」
林明略做思索點點頭：「行，就按你說的來。」
此時，他腦海中再次有淡金色的文字在世界線上浮現出來一【明醫系統·科研輔助模塊·藥效驗證抉擇】
當前狀態：藥效預實驗完成，待大樣本確認。
A方案：每組30隻+四組對照，率領團隊14天內操作零失誤完成，獲得完美數據進入機制實驗。
獎勵：【機制靶點篩查直覺·入門→大成】
B方案：每組30隻+四組對照，率領團隊16天內完成，獲得有效數據進入機制實驗。
獎勵：【機制靶點篩查直覺·入門→小成】
林明還是不假思索地選擇了B項方案。
「行，你們這課題倒是越做越嚴謹了，就得這樣，不要急於求成，要把數據做紮實，這比什麼都重要。」
一旁的陳清源看著林明和卡特琳娜讚許地點頭道。
「後面做到機制實驗，有什麼不明白的地方找我。」
他陳清源既然做了林明這個課題的共同PI，自然不能一直當甩手掌柜，前面驗證預實驗比較簡單，用不著他，後面機制預實驗時肯定地下場相助了。
「陳教授，這可避免不了，後面還得您來扛鼎的！」林明笑道。
「行，那我先走了，你們注意勞逸結合，也不要太趕時間，畢竟你們也有了一筆捐助資金，也不用太趕的。」陳清源說完先走了。
「咦～，林，你們拿到捐款了？」布蘭登驚訝地問道，他還不知道這個消息。
戴維也不知道，此時猛地一眼看向林明，眼神里滿是驚愕！
「嗯，前一段時間剛拿到一筆，不過也不多，臨床實驗的資金還得好好想辦法籌措的。」林明低調地道。
布蘭登還想問一下多少資金，話到嘴邊終究沒問，這個問題稍微有些敏感了。
但戴維忍不住問了出來：「拿到多少？」
「無可奉告。」林明直接道。
「嗤～，誰稀罕！也就三五萬吧？牛什麼！」戴維說著收拾起自己的東西走了。
「別介意，林，他就那樣。」布蘭登低聲道。
「沒事兒，布蘭登，你看我這樣忙，哪有時間理睬螞蚱叫。」林明笑笑，「那不和你聊了，我們得開始忙碌了。」
「好，你們忙你們的，我也得回去了。」布蘭登嘆一口氣，「只是我們這課題後面也不知道會怎樣了，唉，太難了！」
那個新助理研究員和兩個實驗室輪轉研究生也跟在他後面默默地走了。
實驗室一時安靜了下來，林明四人看著布蘭登幾人離去的疲憊和失望的背影，心裡都有些不好受。
「但願他們組能闖過這道難關，不然整個課題組都可能要解散了。」卡特琳娜低聲道，「我們自己也要加把勁兒，但願能順利闖過大樣本重複實驗和機制實驗。」
「但願吧，我們的希望應該很大，畢竟我們的機制實驗沒有他們那麼難。」林明道，」而且有陳教授把關。」
蒂莫西和劉偉沒說什麼，只感覺身上繃緊了一股勁兒。
然後四人明確分工，各自開始忙碌，為明日要啟動的大樣本重複驗證實驗做著準備。
林明統籌實驗方案與質控節點，卡特琳娜整理數據表格與應急預案，蒂莫西調試儀器並校準基線，劉偉覆核試劑配比與樣本編號。
從晚上九點忙到十一點，試劑配平、儀器預熱、流程預演逐一落地，實驗室里原本壓抑的氛圍，被踏實篤定的幹勁徹底沖淡。
（還有更新耶）