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第956章 該說,真不愧是黎曼猜想嗎?

  掛掉袁老的電話之後,趙陽看了一眼時間,晚上七點過十分。

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  「小新,幫我倒一杯熱水。」

  趙陽朝著小新吩咐道。

  「好的主人。」

  現在的小新,已經給它做了很多軀體,效果都非常的不錯,端茶倒水這種事情,對小新來說,輕輕鬆鬆。

  熱水剛到的時候,郵箱提示音剛好響起。

  趙陽看了一眼,時袁老那邊團隊發過來的郵件。

  袁老那邊的人動作確實快,這麼一小會兒,壓縮包就已經發過來了,文件名是一串日期加上雜交水稻母本基因的縮寫,大小將近5個g.

  雷厲風行,就像袁老一樣。

  趙陽心中對這個很讚賞。

  趙陽解壓縮之後把文件夾打開,大概看了一眼,很快心中便有了數。

  裡面的內容分成了幾類:完整的基因組測序數據、表型觀測記錄、實驗田的土壤和氣候參數,還有幾十份手工填寫的紙質記錄掃描件。數據量不算小,而且格式不太統一,有些表格的列名用的是中文簡寫,需要先把它們標準化才能放進同一個分析框架里。

  小新聲音傳來:」主人,這些數據需要做清洗和標註。我建議先把測序數據單獨抽出來做質量評估,然後跟表型數據做關聯映射。紙質掃描件那邊我可以做OCR提取,但裡面有部分手寫體識別率可能偏低。」

  趙陽點了下頭:」先做測序數據的清洗,質量評估的標準按常規閾值走,低於閾值的片段直接剔除。紙質資料我先不看,你把表格類的都整理成統一欄位命名,其他的等第一輪篩選完了再說。」

  小新應了一聲,後台的運算進程開始。趙陽把椅子往前拉了拉,手指放在鍵盤上,開始搭建初步的數學模型。

  這個模型的核心任務看起來很簡單但實際操作起來很複雜。

  畢竟,這可是需要在成千上萬個基因位點中,找出那些跟改良性狀高度相關的候選對象。

  常規的做法是用統計關聯分析挨個位點去測,計算量大而且容易漏掉那些相互作用效應不明顯的組合。

  趙陽的思路不太一樣,他決定先構建一個基於信息熵的篩選框架,把表型數據作為目標變量,然後把基因組上的每個位點看作一個特徵維度,通過計算互信息來評估它們對目標變量的解釋力。

  這個方法的優勢在於不依賴線性假設,能夠捕捉到非線性的關聯模式,但缺點是計算量比傳統方法大了不止一個量級。如果沒有小新的量子計算機做底層支撐,光是這個框架跑一輪就要花掉好幾周的時間。


  他把設計好的算法流程發給小新,由小新調用量子計算資源來做並行加速。屏幕上的進度條動得不算快,但一直在穩步往前推,每一輪疊代之後都會生成一個候選基因列表,從最初的幾百個壓縮到幾十個,再從幾十個篩到十幾個。

  整個過程花了大約一天的時間。到了第二天上午,趙陽刷新了一下結果面板,上面顯示最終的候選基因數量停留在了八個。他又手動核驗了每個候選基因的關聯信號強度和重複性驗證數據,確認沒有明顯的偽陽性。

  他拿起手機撥了袁老的號碼。電話響了兩聲就被接起來了,袁老的聲音聽起來還是帶著那股特有的沙啞和爽快:」趙陽啊,怎麼樣?有結果了?」

  趙陽靠在椅背上說:」數據我昨天收到了,花了一天時間建了個篩選模型跑了一遍。現在候選基因壓到了八個,後面再往下篩難度就比較大了,精度不夠,容易把真正相關的漏掉。您看八個能不能接受?」

  電話那頭安靜了兩秒,然後袁老的聲音明顯提高了些:」一天?你把成千上萬個基因位點篩到只剩八個,只用了一天?」

  趙陽笑了笑:」用了些計算資源的加持,不然靠常規算力確實跑不了這麼快。不過這八個是目前互信息值最高的,後面的信號強度掉得很厲害,所以我建議就先停在這。」

  袁老在電話那邊笑了一聲,聲音里透著高興:」幫大忙了,真的是幫大忙了。八個基因而已,那太好辦了。我們分八個大棚,每個種一種,互相做對照,邊上再留兩個空棚做空白對照和混合對照。八個組而已,實驗設計不複雜,田裡的事交給我就行,你不用擔心。」

  趙陽說那就好,我還怕篩得不夠細耽誤你們進度。

  袁老說耽誤什麼進度,你這一下把前面最耗時間的部分全給省了。他停了一下又說:」說起來,我最近一直在想,第三代超級雜交水稻這一路能走這麼快,跟你過年那段時間來我那兒聊的那一通很有關係。」

  趙陽回憶了一下,春節那幾天他確實去袁老的試驗基地待了兩天,當時兩人聊了不少關於遺傳選擇和統計建模的話題。他當時給袁老提了一個用貝葉斯方法做性狀預測的思路,聽起來不太主流,但袁老聽完之後眼睛亮了好一陣。

  袁老接著說:」那個思路我回來琢磨了一個多月,越琢磨越覺得有道理。後來我們乾脆把之前那套育種框架推翻了重新搭,走了完全不同的方向。這一代跟第二代比,產量潛力可能要高出一截,而且抗逆性指標也有了實質性的改善。你要是秋天有空,一定要來看看。到時候稻子熟了,站在田埂上能聞到稻香,感覺跟你隔著屏幕看數據完全不一樣。」

  趙陽說一定去,秋天無論如何都要抽時間。袁老又跟他聊了一會兒關於雜交水稻的細節,從配組方式說到田間管理,中間還夾雜了幾句關於當地天氣的抱怨,說今年春天雨水偏多,苗期管理費了不少勁。趙陽聽著,偶爾接一兩句,大多數時候只是在電話這頭安靜地聽。


  兩人聊了大約二十多分鐘,袁老那邊有人喊他去開會,他匆匆說了句」秋天見」就掛了。

  趙陽把手機放在桌上,看了兩秒屏幕,然後重新轉向電腦。黎曼猜想那邊的運算腳本還掛在那裡,只是進程卡在了某一組積分估計的收斂性驗證上。他切換過去仔細看了一下報錯信息,發現是圍道路徑上的奇點處理出現了數值不穩定的問題。

  這個問題其實他之前已經有預感了,那條路走到現在這個位置,問題開始變得越來越大。

  前兩周的那個階段成果發出去的時候,他就知道接下來的路會更難,但卻沒想到,居然會難成這樣。

  該說,真不愧是黎曼猜想嗎?

  趙陽微微嘆了口氣,眼神之中滿是無奈。

  真不愧是數學上的皇冠啊!

  後面的每一步都需要同時解決三四個子問題,而這些子問題之間彼此耦合,動一個就要牽連另外幾個。

  他調了幾組參數重新跑了一遍,結果依然不理想,都是圍道在接近臨界帶邊緣的時候出現了發散趨勢,跟預期的路徑偏差越來越遠。

  (還有更新耶)


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