第51章 初入實驗室
翌日
江城大學生物實驗樓三樓，走廊里瀰漫著淡淡的消毒水氣味。
胡彪站在「複雜疾病非編碼RNA功能演化數據分析室」門口，輕輕叩了叩敞開的門。
數據分析室很大，被劃分成幾個區域，靠牆是一排排閃爍著各色指示燈的測序儀和高性能計算伺服器；中間是幾張長實驗台，擺放著離心機、PCR儀等設備；最裡面則是一個小型會議區，白板上寫滿了複雜的公式和通路圖。
四個人正圍在會議區討論著什麼，聽到敲門聲，齊齊轉過頭來。
「請問，哪位是秦語師姐？沈院長讓我來這裡……」胡彪開口。
「你就是胡彪吧？」四人中一名漂亮女生站起身，她看起來二十五六歲，扎著乾淨利落的馬尾，面容清秀，穿著白大褂，裡面是簡單的米色針織衫，「我是秦語，沈老師昨天已經和我們說過了，歡迎加入分析組。」
一個戴著黑框眼鏡、頭髮略顯凌亂的男生也反應過來，他約莫二十七八歲，身材瘦高，穿著格子襯衫和牛仔褲，也站了起來，對著胡彪笑道，「我是陳浩然，也是沈老師的博士生。主要做生物信息學分析，特別是序列比對和功能預測這塊。」
另一個男生看起來年紀稍大，約莫三十出頭，身材微胖，穿著深藍色POLO衫，笑容溫和：「周明遠，博士後，負責課題的整體數據整合和項目管理。咱們這個項目是江城大學和瑞康製藥的校企合作項目。」
最後一位女性看起來最為成熟，約莫三十四五歲，穿著剪裁得體的深灰色西裝套裙，氣質幹練：「我是李薇，瑞康製藥生物信息部的高級研究員，負責將課題組的研究發現與公司的藥物靶點篩選工作對接。」
胡彪微笑著一一問好，心裡對這數據分析室有了初步的認知，秦語負責上游實驗生成數據，陳浩然負責核心分析，周明遠統籌協調，李薇則代表資方並利用資言的資源認證。
「胡彪學弟，你的那篇論文我昨天連夜看完了，正好今天準備驗證一下，你就來了，實在是太好了。對了，你確定你現在是大一？！」陳浩然半開玩笑的道，
胡彪無奈一笑。
實驗室其他幾人也都笑了起來，笑完之後，便是有些尷尬的沉默。
都是理工狗，年紀都不小了，但社交能力進步不大。
「好了，一個個的別和小學弟開玩笑了，陳浩然，你帶學弟熟悉一下實驗室，介紹一下我們的工作，正好，師弟不是擅長數據解構分析嗎？正好讓他分擔一下你那塊的工作，這也是老師的意思。」秦語開口道，年紀最輕的她是數據分析室里的話事人。
「好！」對此，陳浩然也沒什麼不滿，反而很高興，數據分析這種事情，真的是很麻煩，有一個人來幫他分析工作，他高興還來不及呢。
「其實我們這個實驗室只是課題組的一部分，主要承擔的工作就是數據分析對比……」陳浩然帶著胡彪在實驗室轉了一圈，最後來到自己的工位旁，指著旁邊的空位道，「數據分析室不大，但我們人也少，這幾個工位置你隨便選。」
謝謝！
胡彪道了聲謝，選了一個空座位放下了書包，整理好東西，打開電腦。
「師弟，給個郵箱，我把需要分析的數據和需求發給你，有什麼不懂的就來問我。」
「好！」胡彪點了點頭，把自己的郵箱報了出來，接收了數據，然後認真的看了起來。
他一個剛剛插隊進入分析的大一新生，第一天進組能幹什麼？
當然是先熟悉分析室的情況嘍。
就這麼看了半小時，秦語突然推著一個白板走到了實驗室的中心，然後拍了拍手。
「好了，大家都過來吧，對照組那邊剛剛發來一組數據，需要分析，要的很急，大家都來看看！」
秦語一邊說，一邊拿著筆在白板上寫著，不多時，小白板上就布滿了符文一般的數學符號和數據，「這是一組與神經退行性疾病相關的長鏈非編碼RNA序列。這些序列在不同物種間保守性極低，但臨床數據又強烈提示它們可能在疾病發生中起調控作用。」
「問題在於，」秦語指著白板上的一串序列比對圖，「用傳統的Clustal Omega、MAFFT這些工具比對，結果簡直一團糟。高變區域完全無法對齊，更別提識別可能的功能模塊了。」
這時，李薇適時補充道：「公司那邊希望能在年底前鎖定幾個有潛力的靶點進入初步篩選。如果序列比對這關都過不了，後續的保守性分析、二級結構預測、互作網絡構建全都無從談起。」
陳浩然看著白板上的內容，眉頭微微一挑，轉頭對胡彪道，「師弟，你看看這幾組序列，適不適用你提出的多序列對比算法，我記得你的論文裡有相關的內容。」
「呃，這個……」
「讓讓，都讓讓，讓我們的小師弟裝個逼！」
一邊的周明揚叫了起來，一臉興奮的模樣。
胡彪有些懵，看著白板上有如天書一般雜亂無章的序列，扯了扯嘴角，「裝逼，裝個鬼啊，我才大一，你覺得這東西是我能裝的嗎？這種序列，光是建模就要好幾天……」
「浩然，你怎麼看？」
陳浩然搖了搖頭，「這些序列長度差異很大，又不能隨意修剪，因為我們不知道修剪閾值，這裡面的度很難把握。剪多了怕丟失功能區域，剪少了又解決不了根本問題，師弟，我不是開玩笑，你的多序列對比算法可能會有幫助，不過，對你的那個算法我還沒有吃透，有些地方，還需要你幫忙。」
「浩然，看來你是有思路了？」秦語似乎看出了點什麼，問道。
「也不能算是思路吧。」陳浩然站起來，走到白板前，拿起記號筆，在白板空白處畫了起來，「算是受到師弟那篇論文的啟發，如果用動態規劃結合熵權模型，我們可以設計一個自適應閾值。簡單來說，不是固定一個長度或複雜度閾值，而是讓算法根據局部序列特徵動態決定哪些區域需要被重點對待，哪些可以相對寬鬆。」
他迅速勾勒出一個簡單的算法框架：「比如這裡，我們可以引入一個基於局部信息熵的權重函數。在序列高度變化的區域，降低嚴格比對的權重，允許更多的空位插入；而在相對保守的區域，則提高權重，確保核心功能模塊對齊的精確性。」
秦語眼睛一亮：「這相當於給算法加了一個注意力機制，讓它知道該在哪裡聚焦？」
「可以這麼理解。」陳浩然點頭，「不過實現起來，需要在動態規劃的核心遞推公式里嵌入一個權重調整項。這就需要師弟的幫助了，畢竟論文是你寫的，其中的一些思路，還是你最清楚。」
「那就試試吧！」胡彪苦笑道。
話都說到這個份上了，想要推辭也不可能了。
接下來的幾個小時，陳浩然幫他配置好了計算環境，秦語提供了數據訪問路徑和元數據說明，周明遠則協調了伺服器資源的優先級。
胡彪算是真正見識了一個真正的生物實驗室的工作流程。
不管怎麼說，收穫還是很大的。
下午，就在他與陳浩然討論算法的時候，手機震動起來，他瞥了一眼屏幕，是林晚晴。
「抱歉，我接個電話。」他走到實驗室外的走廊。
電話剛一接通，林晚晴帶著委屈和怒意的聲音就傳了過來：「胡彪！你現在在哪？我可被你害慘了！」
（還有更新耶）